Membre du parti les Verts, docteur en médecine et en science, directeur de recherche au CNRS, Marc Lipinski est depuis 2004 Vice-président du Conseil régional d’Île-de-France, en charge de l’enseignement supérieur, de la Recherche et de l’innovation. À ce titre, il a développé une politique régionale en faveur de la recherche en inventant le concept des Domaines d’intérêt majeur (DIM), qui donnent une priorité pour les sciences du vivant et les sciences humaines et sociales.

Marc Lipinski est aussi à l’origine de la création de l’institut Émilie du Châtelet pour les recherches sur les femmes, le sexe et le genre. Il est aussi le «père» des PICRI – Partenariats institutions-citoyens pour la recherche et l’innovation – grâce auxquels des associations bénéficient de crédits pour mener des recherches aux côtés d’acteurs académiques.

Pour rapprocher science et société, il a dès 2006 organisé une Conférence de citoyens sur les nanotechnologies. Enfin, Marc Lipinski a créé l’Aide à l’innovation responsable, en mettant en place deux structures d'aide au PME-TPE : le Centre francilien de l’innovation et le Lieu du design.